Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Syne2Q6ZWQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms