Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX8Q6ZV50 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX8Q6ZV50 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms