Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Ncapd3Q6ZQK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ncapd3Q6ZQK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms