Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cand1Q6ZQ38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cand1Q6ZQ38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms