Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CASC2Q6XLA1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CASC2Q6XLA1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms