Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2eQ6VUP9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2eQ6VUP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2eQ6VUP9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2eQ6VUP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2eQ6VUP9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2eQ6VUP9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tfap2eQ6VUP9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tfap2eQ6VUP9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms