Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms