Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO2Q6UXX9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO2Q6UXX9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO2Q6UXX9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms