Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcaf3Q6QR59 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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Tcaf3Q6QR59 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcaf3Q6QR59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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