Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd4Q6PDQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd4Q6PDQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd4Q6PDQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd4Q6PDQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd4Q6PDQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms