Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ecm29Q6PDI5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ecm29Q6PDI5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ecm29Q6PDI5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms