Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AtminQ6P9S1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AtminQ6P9S1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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