Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms