Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD2Q6P5Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LMOD2Q6P5Q4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMOD2Q6P5Q4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms