Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NesQ6P5H2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NesQ6P5H2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NesQ6P5H2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms