Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gga2Q6P5E6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gga2Q6P5E6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gga2Q6P5E6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gga2Q6P5E6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.3 ms