Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RbfaQ6P3B9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms