Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D0

ZFP1, Zinc finger protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP1Q6P2D0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP1Q6P2D0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP1Q6P2D0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP1Q6P2D0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms