Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slx4Q6P1D7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slx4Q6P1D7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slx4Q6P1D7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Slx4Q6P1D7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms