Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac4Q6NZM9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac4Q6NZM9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms