Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc8Q6NZB0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc8Q6NZB0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnajc8Q6NZB0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc8Q6NZB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms