Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krba1Q6NXZ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms