Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Szrd1Q6NXN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Szrd1Q6NXN1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278 ms