Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Asic1Q6NXK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Asic1Q6NXK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Asic1Q6NXK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Asic1Q6NXK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Asic1Q6NXK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Asic1Q6NXK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms