Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpbp1Q6NXH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpbp1Q6NXH3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpbp1Q6NXH3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpbp1Q6NXH3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms