Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2surpQ6NV83 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
U2surpQ6NV83 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.57■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
U2surpQ6NV83 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
U2surpQ6NV83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms