Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TBC1D3CQ6IPX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBC1D3CQ6IPX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBC1D3CQ6IPX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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