Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN2Q6IMN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN2Q6IMN6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms