Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD4Q6IC98 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRAMD4Q6IC98 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD4Q6IC98 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms