Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msl2Q69ZF8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msl2Q69ZF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms