Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM200BQ69YZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM200BQ69YZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.7 ms