Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sptbn2Q68FG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sptbn2Q68FG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sptbn2Q68FG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms