Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
E4F1Q66K89 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms