Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zic3Q62521 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms