Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufa4Q62425 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa4Q62425 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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