Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zpr1Q62384 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zpr1Q62384 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zpr1Q62384 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms