Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim21Q62191 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim21Q62191 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 283.5 ms