Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm1Q61937 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Npm1Q61937 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Npm1Q61937 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Npm1Q61937 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms