Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga6Q61739 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga6Q61739 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga6Q61739 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms