Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Erbb3Q61526 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Erbb3Q61526 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Erbb3Q61526 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Erbb3Q61526 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Erbb3Q61526 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms