Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1eQ61290 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1eQ61290 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms