Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4bQ61136 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf4bQ61136 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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