Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17laQ61068 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17laQ61068 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17laQ61068 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms