Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NinQ61043 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinQ61043 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinQ61043 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinQ61043 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NinQ61043 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NinQ61043 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NinQ61043 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NinQ61043 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinQ61043 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NinQ61043 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinQ61043 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinQ61043 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NinQ61043 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NinQ61043 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinQ61043 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinQ61043 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinQ61043 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinQ61043 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NinQ61043 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinQ61043 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinQ61043 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NinQ61043 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinQ61043 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinQ61043 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NinQ61043 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NinQ61043 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NinQ61043 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinQ61043 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NinQ61043 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinQ61043 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinQ61043 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinQ61043 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NinQ61043 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinQ61043 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinQ61043 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinQ61043 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinQ61043 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinQ61043 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NinQ61043 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NinQ61043 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinQ61043 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NinQ61043 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NinQ61043 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinQ61043 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinQ61043 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NinQ61043 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms