Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf8Q60846 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf8Q60846 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf8Q60846 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms