Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn11Q60771 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cldn11Q60771 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn11Q60771 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms