Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb6Q60692 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb6Q60692 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb6Q60692 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms