Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgaeQ60677 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms