Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a3Q5XF89 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp13a3Q5XF89 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms