Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLIPQ5VWP3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLIPQ5VWP3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms